The long non-coding RNA OTX2-AS1 promotes tumor growth and predicts response to BCL-2 inhibition in medulloblastoma

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftForschungsartikelBeigetragenBegutachtung

Beitragende

  • Nan Qin - , Universitätsklinikum Düsseldorf, Heinrich Heine Universität Düsseldorf, Mildred Scheel School of Oncology Aachen Bonn Cologne Düsseldorf (MSSO ABCD) (Autor:in)
  • Eunice Paisana - , Universidade de Lisboa (Autor:in)
  • Daniel Picard - , Universitätsklinikum Düsseldorf (Autor:in)
  • Gabriel Leprivier - , Universitätsklinikum Düsseldorf (Autor:in)
  • Maike Langini - , Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus Dresden, Heinrich Heine Universität Düsseldorf, Institut für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin (Autor:in)
  • Carlos Custódia - , Universidade de Lisboa (Autor:in)
  • Rita Cascão - , Universidade de Lisboa (Autor:in)
  • Anja Stefanski - , Heinrich Heine Universität Düsseldorf (Autor:in)
  • Catleen Conrad - , Technische Universität Bergakademie Freiberg, Technische Universität Dresden, Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus Dresden, Institut für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin (Autor:in)
  • Mirko Peitzsch - , Institut für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin, Hochschulmedizin (Medizinische Fakultät und Universitätsklinikum) (Autor:in)
  • Kai Stühler - , Heinrich Heine Universität Düsseldorf (Autor:in)
  • Ute Fischer - , Universitätsklinikum Düsseldorf (Autor:in)
  • Claudia C. Faria - , Universidade de Lisboa (Autor:in)
  • Sascha Dietrich - , Universitätsklinikum Düsseldorf (Autor:in)
  • Guido Reifenberger - , Universitätsklinikum Düsseldorf, Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) (Autor:in)
  • Marc Remke - , Universitätsklinikum Düsseldorf, Heinrich Heine Universität Düsseldorf, Universität des Saarlandes (Autor:in)

Abstract

Purpose: Primary brain tumors are a leading cause of cancer-related death in children, and medulloblastoma is the most common malignant pediatric brain tumor. The current molecular characterization of medulloblastoma is mainly based on protein-coding genes, while little is known about the involvement of long non-coding RNAs (lncRNAs). This study aimed to elucidate the role of the lncRNA OTX2-AS1 in medulloblastoma. Methods: Analyses of DNA copy number alterations, methylation profiles, and gene expression data were used to characterize molecular alterations of OTX2-AS1 in medulloblastoma tissue samples. In vitro analyses of medulloblastoma cell models and orthotopic in vivo experiments were carried out for functional characterization of OTX2-AS1. High-throughput drug screening was employed to identify pharmacological inhibitors, while proteomics and metabolomics analyses were performed to address potential mechanisms of drug action. Results: We detected amplification and consecutive overexpression of OTX2 and OTX2-AS1 in a subset of medulloblastomas. In addition, OTX2-AS1 promoter methylation was linked to OTX2-AS1 expression. OTX2-AS1 knockout reduced medulloblastoma cell viability and cell migration in vitro and prolonged survival in the D283 orthotopic medulloblastoma mouse xenograft model. Pharmacological inhibition of BCL-2 suppressed the growth of OTX2-AS1 overexpressing medulloblastoma cells in vitro. Conclusions: Our study revealed a pro-tumorigenic role of OTX2-AS1 in medulloblastoma and identified BCL-2 inhibition as a potential therapeutic approach to target OTX2-AS1 overexpressing medulloblastoma cells.

Details

OriginalspracheEnglisch
Seiten (von - bis)329-342
Seitenumfang14
FachzeitschriftJournal of neuro-oncology
Jahrgang165
Ausgabenummer2
PublikationsstatusVeröffentlicht - Nov. 2023
Peer-Review-StatusJa

Externe IDs

PubMed 37976029

Schlagworte

Ziele für nachhaltige Entwicklung

Schlagwörter

  • BCL-2 inhibitor, High-throughput drug screening, LncRNA, Medulloblastoma, OTX2-AS1