MoSGrid-a molecular simulation grid as a new tool in computational chemistry, biology and material science

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftForschungsartikelBeigetragenBegutachtung

Beitragende

  • Georg Birkenheuer - , Paderborn University (Autor:in)
  • Dirk Blunk - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • Sebastian Breuers - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • A. Brinkmann - , Paderborn University (Autor:in)
  • I. Dos Santos Vieira - , Technische Universität (TU) Dortmund (Autor:in)
  • Gregor Fels - , Paderborn University (Autor:in)
  • S. Gesing - , Eberhard Karls Universität Tübingen (Autor:in)
  • R. Grunzke - , Technische Universität Dresden (Autor:in)
  • S. Herres-Pawlis - , Technische Universität (TU) Dortmund (Autor:in)
  • O. Kohlbacher - , Eberhard Karls Universität Tübingen (Autor:in)
  • N. Kruber - , Zuse Institute Berlin (Autor:in)
  • J. Krüger - , Paderborn University (Autor:in)
  • U. Lang - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • L. Packschies - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • R. Müller-Pfefferkorn - , Zentrum für Informationsdienste und Hochleistungsrechnen (ZIH) (Autor:in)
  • P. Schäfer - , Zuse Institute Berlin (Autor:in)
  • H. G. Schmalz - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • Thomas Steinke - , Zuse Institute Berlin (Autor:in)
  • Klaus-Dieter Warzecha - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • Martin Wewior - , Universität zu Köln (Autor:in)

Abstract

The MoSGrid (Molecular Simulation Grid, http://www.mosgrid.de) project aims to provide remote computational chemistry services within the German Grid Initiative (D-Grid).

Submission and monitoring of compute jobs, as well as the retrieval of postprocessed results are realized through a web based portal. The use of standardized portlets and a generally modular approach allows for the simultaneous and independent implementation of frontends for different molecular simulation codes. To date, functional prototypes of portlets for applications from the quantum chemical and the molecular dynamics domain are available, being represented by Gaussian and Gromacs, respectively. The implementation of other quantum chemical codes, as requested by the community, and of codes for docking simulations is in preparation.

MoSGrid will furthermore foster efficient and collaborative work by providing secure but shareable repositories for validated data, as well as for reusable recipes and workflows.

Details

OriginalspracheEnglisch
AufsatznummerP14
FachzeitschriftJournal of cheminformatics
Jahrgang3
AusgabenummerSUPPL. 1
PublikationsstatusVeröffentlicht - 19 Apr. 2011
Peer-Review-StatusJa