MoSGrid-a molecular simulation grid as a new tool in computational chemistry, biology and material science

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftMeeting AbstractBeigetragenBegutachtung

Beitragende

  • Georg Birkenheuer - , Universität Paderborn (Autor:in)
  • Dirk Blunk - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • Sebastian Breuers - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • A. Brinkmann - , Universität Paderborn (Autor:in)
  • I. Dos Santos Vieira - , Technische Universität (TU) Dortmund (Autor:in)
  • Gregor Fels - , Universität Paderborn (Autor:in)
  • S. Gesing - , Eberhard Karls Universität Tübingen (Autor:in)
  • R. Grunzke - , Zentrum für Informationsdienste und Hochleistungsrechnen (ZIH) (Autor:in)
  • S. Herres-Pawlis - , Technische Universität (TU) Dortmund (Autor:in)
  • O. Kohlbacher - , Eberhard Karls Universität Tübingen (Autor:in)
  • N. Kruber - , Zuse Institute Berlin (Autor:in)
  • J. Krüger - , Universität Paderborn (Autor:in)
  • U. Lang - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • L. Packschies - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • R. Müller-Pfefferkorn - , Zentrum für Informationsdienste und Hochleistungsrechnen (ZIH) (Autor:in)
  • P. Schäfer - , Zuse Institute Berlin (Autor:in)
  • H. G. Schmalz - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • Thomas Steinke - , Zuse Institute Berlin (Autor:in)
  • Klaus-Dieter Warzecha - , Universität zu Köln (Autor:in)
  • Martin Wewior - , Universität zu Köln (Autor:in)

Abstract

The MoSGrid (Molecular Simulation Grid, http://www.mosgrid.de) project aims to provide remote computational chemistry services within the German Grid Initiative (D-Grid).

Submission and monitoring of compute jobs, as well as the retrieval of postprocessed results are realized through a web based portal. The use of standardized portlets and a generally modular approach allows for the simultaneous and independent implementation of frontends for different molecular simulation codes. To date, functional prototypes of portlets for applications from the quantum chemical and the molecular dynamics domain are available, being represented by Gaussian and Gromacs, respectively. The implementation of other quantum chemical codes, as requested by the community, and of codes for docking simulations is in preparation.

MoSGrid will furthermore foster efficient and collaborative work by providing secure but shareable repositories for validated data, as well as for reusable recipes and workflows.

Details

OriginalspracheEnglisch
AufsatznummerP14
FachzeitschriftJournal of cheminformatics
Jahrgang3
AusgabenummerSuppl 1
PublikationsstatusVeröffentlicht - 19 Apr. 2011
Peer-Review-StatusJa

Konferenz

Titel6th German Conference on Chemoinformatics
KurztitelGCC 2010
Veranstaltungsnummer6
Dauer7 - 9 November 2010
Ort
StadtGoslar
LandDeutschland

Externe IDs

Scopus 79955040588
ORCID /0000-0001-8719-5741/work/173053672

Schlagworte

Forschungsprofillinien der TU Dresden