Toward the identification and regulation of the Arabidopsis thaliana ABI3 regulon

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftForschungsartikelBeigetragenBegutachtung

Beitragende

  • Gudrun Mönke - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Michael Seifert - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Jens Keilwagen - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Michaela Mohr - , Gesellschaft für Wissenschaftliche Datenverarbeitung GmbH (Autor:in)
  • Ivo Grosse - , Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg (Autor:in)
  • Urs Hähnel - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Astrid Junker - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Bernd Weisshaar - , Universität Bielefeld (Autor:in)
  • Udo Conrad - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Helmut Bäumlein - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)
  • Lothar Altschmied - , Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (Autor:in)

Abstract

The plant-specific, B3 domain-containing transcription factor ABSCISIC ACID INSENSITIVE3 (ABI3) is an essential component of the regulatory network controlling the development and maturation of the Arabidopsis thaliana seed. Genome-wide chromatin immunoprecipitation (ChIP-chip), transcriptome analysis, quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction and a transient promoter activation assay have been combined to identify a set of 98 ABI3 target genes. Most of these presumptive ABI3 targets require the presence of abscisic acid for their activation and are specifically expressed during seed maturation. ABI3 target promoters are enriched for G-box-like and RY-like elements. The general occurrence of these cis motifs in non-ABI3 target promoters suggests the existence of as yet unidentified regulatory signals, some of which may be associated with epigenetic control. Several members of the ABI3 regulon are also regulated by other transcription factors, including the seed-specific, B3 domain-containing FUS3 and LEC2. The data strengthen and extend the notion that ABI3 is essential for the protection of embryonic structures from desiccation and raise pertinent questions regarding the specificity of promoter recognition.

Details

OriginalspracheEnglisch
Seiten (von - bis)8240-8254
Seitenumfang15
FachzeitschriftNucleic acids research
Jahrgang40
Ausgabenummer17
PublikationsstatusVeröffentlicht - 1 Sept. 2012
Peer-Review-StatusJa
Extern publiziertJa

Externe IDs

PubMedCentral PMC3458547
Scopus 84866902488
ORCID /0000-0002-2844-053X/work/153655337

Schlagworte

Schlagwörter

  • Arabidopsis/embryology, Arabidopsis Proteins/metabolism, Chromatin Immunoprecipitation, DNA, Plant/chemistry, Gene Expression Profiling, Gene Expression Regulation, Plant, Nucleotide Motifs, Promoter Regions, Genetic, Regulon, Seeds/metabolism, Transcription Factors/metabolism